种子岛航天中心隶属于日本宇宙开发事业团，是日本应用卫星发射中心。它位于种子岛的东南端，在鹿儿岛航天中心以南约100公里处，航天中心的总面积约为8.65平方公里。该岛属亚热带气候，年平均气温19.5℃。
种子岛航天中心主要由竹崎发射场、大崎发射场以及吉信综合发射场组成。
竹崎发射场
竹崎发射场于1966年9月开始营建，1968年投入使用。该发射场占地面积约0.79平方公里，位于北纬30°22′20″，东经 130°57′55″。主要用来发射小型卫星。该发射场的主要设施有发射台、发射控制室、装配车间、综合测试车间、气象观测室、固体火箭点火试车台、推进剂库、跟踪站等。
大崎发射场
大崎发射场于1969年开始营建，1980年全部建成，占地面积约7.6平方公里，位于北纬30°23′38″，东经130°58′22″。该发射场主要用来发射大型液体火箭，如N火箭和H-1火箭。1975年9月，第一枚H-1火箭从这里起飞，把83公斤重的菊花卫星送入轨道。
大崎发射场的发射设施主要包括发射台、控制中心、火箭总装车间、推进剂贮存库、发动机静态点火试车台、气象台等。
吉信发射场
吉信发射场于1985年开始兴建，1986年底勤务塔基础工程基本结束，1988年8月建成发射控制中心，1988年12月建成LE-7发动机点火试验设施。测控中心、动力站、液氧、液氢以及高压气体库等也相继建成。该发射场位于大崎发射场东北方向约1公里处，是为适应H-2新型运载火箭的发射而兴建的。
吉信发射场的设计基本要求是：缩短发射场的发射准备周期，降低操作费用，45天内能发射两枚运载火箭；发射场的设计具有灵活性，以利于将来进行改建与扩建。为了体现上述要求，设计尽量采用平行作业；采用自动检测系统(手动的备份系统)；采用一个活动发射架和一个火箭装配厂房，一发火箭进行装配，另一发火箭准备发射。
吉信发射场是目前世界上最大的和最现代化的发射场之一。它可与库鲁的阿里安4发射场以及卡纳维拉尔角的大力神3发射场相媲美。发射场耗资33亿美元(1990年币值)，主承包商是三菱重工业公司。
主要由四个工作场区组成：固体发动机贮存及检验区；卫星准备与总装区；运载火箭装配楼区；发射台及服务塔区。
